被纳入高盛体系下J.Aron公司的业务有待调整和恢复，布兰克费恩在这一过程起着不可替代的作用。公司业务扩展到咖啡、金属贸易、原油、外汇交易等多个领域。到90年代初J.Aron所创利润已经占到高盛财团总利润的三分之一甚至更多。J.Aron在高盛内部成为了一个有着巨大吸引力的地方。伴随着J.Aron的崛起和快速发展的还有布兰克费恩，他在这期间的表现越来越受到高盛高层的重视。布兰克费恩当初的目标达到了，在高盛他不仅站稳了脚跟，还为自己日后的跃升打好了坚实的基础。
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布兰克费恩真正在高盛集团脱颖而出让人刮目相看的是在2002年，这一年布兰克费恩所掌管的高盛的支柱部门---固定收益商品部创造了高达1270万美元的收益，而当时高盛董事长兼CEO的鲍尔森所负责部门产生的收益也不过只有960万美元。一时间布兰克费恩的名字变得响亮厚重起来。
鉴于J.Aron在高盛集团内部的位置越来越重要，1997年高盛将J.Aron与其固定收益业务合并，建立了固定收益商品部（简称FICC），布兰克费恩被任命为这部分业务的主管。布兰克费恩的领导大大增强了FICC的交易能力，且使其保持着快速恒定的增长态势，FICC的收入从1999年28.6亿美元上升到2003年的55.9亿美元，至今FICC都保持在高盛内部主干的作用。2003年初，布兰克费恩成为高盛上市后的第一位也是唯一意味进入公司董事会的员工。
在这之前鲍尔森有两位公认的接班人，一个是野心勃勃的约翰·桑顿，他曾将高盛的业务成功打入欧洲和亚洲市场，而另一位是约翰·赛恩（2003年出任纽交所CEO,2007年末就任美林证券CEO）。没有人关注到布兰克费恩，但是FICC的接连佳绩，以及高盛集团的总收入对FICC表现出极大的依赖性，有观察家认为如果高盛继续保持对FICC的高度依赖那么布兰克费恩就是那个等待接替鲍尔森的最佳人选。果然不久之后这个预言被证实了。2003年12月布兰克费恩成为高盛总裁兼首席运营官，而两位早就被看好的接班人桑顿和赛恩则于2003年底先后离开了高盛挂冠而去。
有分析认为布兰克费恩的成功主要有两大原因，一是他懂得如何通过公司的自营交易而不是通过兜揽高端客户来创造利润，这是布兰克费恩的一个特长，另一个原因则是自营交易近年来已经形成潮流，布兰克费恩所具备的特长正式顺应了这种潮流的需要。善于发现机遇并且能以最快的速度反应并将其充分利用，这是布兰克费恩的一个重要特质。2003年第四季度，FICC的收入达到11亿美元，约为高盛集团同期净收入的1/4。更为重要的是，据分析师们称，该子公司对高盛利润的贡献率更要高得多，约为35%。因为在FICC出色的表现，2002年布兰克费恩的薪酬就占据了高盛的至高点，2003年底高盛公司宣布，布兰克费恩当年的薪酬是2000万美元，少部分是限制性股票，多数为现金。
2006年6月时任高盛集团CEO的亨利·鲍尔森被美国总统布什任命为财政部长职务，自然布兰克费恩成为鲍尔森的不二人选。6月2日，高盛董事会宣布，任命总裁兼首席运营官的布兰克费恩为新任CEO兼董事长。凭借优秀的交易技能，布兰克费恩走到了高盛集团的最高位置。2006年因为带领高盛继续乘风快速前进，布兰克费恩本人再获丰厚回报，年终奖高达5340万美元，也创下了华尔街投资银行年终奖金的新纪录。2007年因为率领高盛集团平稳度过次信贷危机，他获得的年终奖刷新了自己在2006年创造的华尔街纪录，高达6790万美元。
布兰克费恩此时，无限风光。
